More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3248 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3299  carboxyl transferase domain-containing protein  95.34 
 
 		 536 aa  1061    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.96484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4093  propionyl-CoA carboxylase  86.76 
 
 		 574 aa  1046    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0491  Propionyl-CoA carboxylase  84.67 
 
 		 574 aa  1033    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.669185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3248  carboxyl transferase  100 
 
 		 574 aa  1181    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000151577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0562  carboxyl transferase  83.28 
 
 		 574 aa  1004    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0463  propionyl-CoA carboxylase  85.19 
 
 		 574 aa  1038    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3488  propionyl-CoA carboxylase  81.71 
 
 		 574 aa  994    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3262  Propionyl-CoA carboxylase  83.28 
 
 		 574 aa  1007    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0496  Propionyl-CoA carboxylase  85.37 
 
 		 574 aa  1041    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0575  Propionyl-CoA carboxylase  83.45 
 
 		 574 aa  1005    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0651  propionyl-CoA carboxylase  84.49 
 
 		 574 aa  1016    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  36 
 
 		 513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  35.3 
 
 		 514 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  39.63 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  35.76 
 
 		 521 aa  296  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  39.63 
 
 		 515 aa  296  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  34.1 
 
 		 511 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  34.03 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  34.94 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  38.14 
 
 		 510 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  38.75 
 
 		 508 aa  292  9e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  35.95 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  38.14 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  33.66 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  34.36 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  36.71 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  34.1 
 
 		 520 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  39.77 
 
 		 514 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  33.65 
 
 		 510 aa  289  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  32.96 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  33.65 
 
 		 510 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  37.59 
 
 		 510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  38.52 
 
 		 508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  34.25 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  33.59 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  33.98 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  37.53 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  33.59 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  33.98 
 
 		 510 aa  284  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  33.78 
 
 		 510 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  37.16 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  33.15 
 
 		 518 aa  283  6.000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 518 aa  283  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  33.02 
 
 		 510 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.04 
 
 		 513 aa  283  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  36.72 
 
 		 520 aa  282  9e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  34.43 
 
 		 513 aa  283  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  34.95 
 
 		 510 aa  282  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  33.58 
 
 		 519 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  33.21 
 
 		 517 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  32.63 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.28 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  33.91 
 
 		 514 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  34.48 
 
 		 513 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  33.01 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  34.37 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  37.62 
 
 		 517 aa  280  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  32.47 
 
 		 523 aa  279  8e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  38.36 
 
 		 529 aa  279  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  34.16 
 
 		 531 aa  279  9e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  35.74 
 
 		 549 aa  279  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  38.28 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  35.45 
 
 		 564 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  34.22 
 
 		 527 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.6 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  33.65 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.42 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  38.9 
 
 		 522 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  32.82 
 
 		 531 aa  278  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  33.78 
 
 		 516 aa  277  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  32.31 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  34.33 
 
 		 513 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  35.05 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  34.06 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  37.15 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  31.89 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  33.52 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  33.97 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  37.71 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  35.63 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  37.62 
 
 		 528 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 536 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  34.77 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  34.26 
 
 		 548 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  32.12 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  33.01 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  36.94 
 
 		 508 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  31.68 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  32.62 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  35.08 
 
 		 518 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  33.46 
 
 		 529 aa  273  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  33.4 
 
 		 514 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  32.62 
 
 		 510 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.46 
 
 		 534 aa  273  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  33.99 
 
 		 550 aa  273  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>