More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2444 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  84.77 
 
 
663 aa  1131    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  76.47 
 
 
663 aa  1041    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  73.14 
 
 
657 aa  952    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  65 
 
 
654 aa  851    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
663 aa  1332    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  75.57 
 
 
663 aa  1032    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  79.7 
 
 
662 aa  1093    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  57.1 
 
 
664 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  73.07 
 
 
665 aa  983    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.91 
 
 
688 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  43.22 
 
 
689 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  44.46 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  44.61 
 
 
688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.68 
 
 
649 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  50.32 
 
 
487 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  48.97 
 
 
488 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  39.94 
 
 
661 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  40.28 
 
 
616 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  48.77 
 
 
488 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  41.97 
 
 
654 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  44.3 
 
 
480 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  38.26 
 
 
607 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  39.84 
 
 
663 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  39.69 
 
 
650 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  38.08 
 
 
659 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  38.32 
 
 
607 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.99 
 
 
614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  36.27 
 
 
634 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.89 
 
 
658 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  34.09 
 
 
610 aa  294  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  30.23 
 
 
657 aa  292  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  34.25 
 
 
616 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  30.02 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
662 aa  283  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 
623 aa  280  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.41 
 
 
606 aa  280  8e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  32.21 
 
 
624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  32.93 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 
666 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.5 
 
 
619 aa  275  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  30.9 
 
 
576 aa  273  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  30.55 
 
 
576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  30.59 
 
 
576 aa  270  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  31.3 
 
 
665 aa  270  8.999999999999999e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  30.76 
 
 
620 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  30.29 
 
 
680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  29.9 
 
 
669 aa  266  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.17 
 
 
741 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.75 
 
 
669 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.11 
 
 
676 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 
786 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  31.83 
 
 
666 aa  262  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 
728 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  29.69 
 
 
647 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31.74 
 
 
743 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.55 
 
 
662 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 
664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.15 
 
 
647 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  30.96 
 
 
688 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.65 
 
 
662 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 
646 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
740 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  31.87 
 
 
844 aa  253  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  31.57 
 
 
741 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
662 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  30.36 
 
 
747 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  29.24 
 
 
662 aa  252  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  31.14 
 
 
676 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 
720 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.07 
 
 
680 aa  250  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  30.98 
 
 
738 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
740 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.5 
 
 
662 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.79 
 
 
662 aa  249  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 
713 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  30.7 
 
 
753 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.94 
 
 
571 aa  247  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  32.39 
 
 
772 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  28.44 
 
 
647 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  31.62 
 
 
829 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  29.94 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  29.73 
 
 
665 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.67 
 
 
776 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  29.21 
 
 
764 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 
665 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  29.28 
 
 
720 aa  241  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 
712 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  30.6 
 
 
778 aa  240  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.17 
 
 
631 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
782 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  33.45 
 
 
732 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.22 
 
 
715 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
725 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  33.27 
 
 
766 aa  238  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  31.93 
 
 
774 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>