More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0205 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 303 aa  633    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  89.77 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  76.9 
 
 		 303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  78.15 
 
 		 305 aa  507  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  75.25 
 
 		 303 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  73.84 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 		 307 aa  362  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 		 300 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 		 309 aa  346  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 300 aa  339  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 303 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 		 309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 		 321 aa  335  7.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 304 aa  334  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  51.57 
 
 		 305 aa  328  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 326 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 302 aa  318  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 298 aa  315  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 305 aa  316  4e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 305 aa  315  8e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 560 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 306 aa  311  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 305 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 329 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.7 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 306 aa  308  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 		 320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>