270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1354 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 		 65 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 62 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  55.93 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  49.15 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  46.77 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  45.16 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  64.86 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  54.35 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  64.86 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  49.09 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  56.25 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>