50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0815 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  59.33 
 
 
330 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  56.35 
 
 
328 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  55.73 
 
 
328 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  42.77 
 
 
341 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  42.77 
 
 
341 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  43.69 
 
 
344 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  41.14 
 
 
341 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  44.44 
 
 
355 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  44.13 
 
 
351 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  41.81 
 
 
363 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  43.29 
 
 
351 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  41.74 
 
 
361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  40.97 
 
 
364 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  41.9 
 
 
360 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  41.9 
 
 
360 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  41.9 
 
 
360 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  41.9 
 
 
360 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  41.9 
 
 
360 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  38.97 
 
 
344 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  40.48 
 
 
361 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  40.79 
 
 
341 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  39.79 
 
 
361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  39.06 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  38.38 
 
 
336 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  40.14 
 
 
361 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  38.51 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  39.31 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  36.42 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  38.62 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  39.31 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  39.31 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  39.31 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  39.31 
 
 
361 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  38.28 
 
 
344 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  39.02 
 
 
335 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  39.35 
 
 
335 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  40.34 
 
 
336 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  38.64 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  38.33 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  40.77 
 
 
336 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  35.1 
 
 
336 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  38.91 
 
 
343 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  41.77 
 
 
356 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  40.25 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  36.55 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  40.27 
 
 
335 aa  158  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  40.65 
 
 
352 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  38.4 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  38.4 
 
 
359 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>