259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3453 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
368 aa  740    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  35.05 
 
 
307 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 
298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 
313 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 
313 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.74 
 
 
318 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  30.63 
 
 
308 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
286 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  31 
 
 
314 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  32.83 
 
 
329 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  31.37 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  30.61 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  29.66 
 
 
316 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
330 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  30.45 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  31.06 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  31.44 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  31.74 
 
 
339 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  31.12 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  28.06 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  29.24 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  27.95 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  30.72 
 
 
369 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  29.78 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 
327 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  27.55 
 
 
312 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  29.41 
 
 
335 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  29.89 
 
 
377 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  29.56 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  28.44 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  29.78 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  27.91 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 
313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  30 
 
 
309 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  28.24 
 
 
287 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
371 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  26.56 
 
 
307 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  26.36 
 
 
336 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 
334 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  27.88 
 
 
314 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  28.88 
 
 
301 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  27.95 
 
 
315 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  27.95 
 
 
315 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  25.53 
 
 
307 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  26.97 
 
 
330 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  29.75 
 
 
325 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2938  OmpA/MotB  28.2 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.443593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 
336 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  31.61 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4558  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 
277 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  34.33 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3057  OmpA/MotB domain-containing protein  29.03 
 
 
277 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  26.81 
 
 
273 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1144  flagellar motor protein MotB  52 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  28.7 
 
 
339 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  33.12 
 
 
346 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  33.95 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  27.1 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  27.1 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0284  flagellar motor protein MotB  52.56 
 
 
452 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0642  OmpA/MotB domain protein  43.41 
 
 
462 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0469396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0631  OmpA/MotB domain-containing protein  43.41 
 
 
468 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  0.662195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.15 
 
 
264 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3243  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 
285 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.612152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  35.9 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  35.9 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  25.87 
 
 
273 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2834  OmpA/MotB  33.14 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155442  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0610  OmpA/MotB domain protein  43.44 
 
 
470 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0096444  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4198  flagellar motor protein MotB  50.68 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5376  OmpA/MotB domain protein  26.14 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590786  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
274 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  26.2 
 
 
275 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  58.06 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  58.06 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4172  chemotaxis protein MotB  71.74 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  58.06 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  30.46 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  58.06 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  28.86 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1107  flagellar motor protein MotB  54.67 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2687  OmpA/MotB domain-containing protein  49.25 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.826191  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  35.71 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  32.21 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  56.92 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  35 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  25.57 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1679  OmpA/MotB domain-containing protein  50.75 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0303068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>