More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2012 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
178 aa  345  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.5 
 
 
146 aa  158  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.54 
 
 
151 aa  157  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.71 
 
 
173 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1908  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.29 
 
 
151 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  62.5 
 
 
159 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.5 
 
 
146 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.64 
 
 
147 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  52.08 
 
 
148 aa  150  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  53.47 
 
 
157 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  53.47 
 
 
204 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.94 
 
 
148 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  55.94 
 
 
149 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.38 
 
 
164 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.16 
 
 
155 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.83 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  55.71 
 
 
151 aa  144  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.72 
 
 
158 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60 
 
 
158 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
142 aa  140  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.46 
 
 
147 aa  141  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.97 
 
 
154 aa  141  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.46 
 
 
147 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
152 aa  140  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.46 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 
156 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
148 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  46.21 
 
 
153 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
149 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  52.45 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  47.95 
 
 
153 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
145 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.49 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.47 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
145 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  56.94 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.42 
 
 
152 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.82 
 
 
154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.17 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.48 
 
 
162 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
148 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.72 
 
 
156 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.49 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.47 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  40.14 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 
195 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.75 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  55.94 
 
 
143 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  51.43 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  54.55 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  53.38 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  51.39 
 
 
144 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.66 
 
 
176 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.85 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.68 
 
 
168 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.37 
 
 
161 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  51.68 
 
 
167 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.79 
 
 
144 aa  124  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  48.98 
 
 
171 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
150 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  39.19 
 
 
158 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0469  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  45.45 
 
 
135 aa  121  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.95 
 
 
166 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.41 
 
 
152 aa  121  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
148 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  56.64 
 
 
147 aa  121  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.34 
 
 
175 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.95 
 
 
157 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.97 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  47.55 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  47.65 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.23 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  49.32 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.36 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.65 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  43.24 
 
 
161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  48.25 
 
 
153 aa  117  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.84 
 
 
153 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.59 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.59 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  50.7 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  48.92 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.39 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.36 
 
 
151 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.66 
 
 
148 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1926  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.71 
 
 
144 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512826  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.03 
 
 
484 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.82 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  47.95 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.51 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  46.21 
 
 
166 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.25 
 
 
165 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
150 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>