More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0232 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
498 aa  993    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  54.21 
 
 
533 aa  485  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  42.29 
 
 
509 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  40.12 
 
 
498 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  36.7 
 
 
499 aa  286  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  38.34 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  38.25 
 
 
505 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  36.2 
 
 
548 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  38.12 
 
 
513 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  38.25 
 
 
513 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  38.13 
 
 
501 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  35.64 
 
 
506 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  35.17 
 
 
513 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  35.17 
 
 
513 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 
501 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  34.87 
 
 
506 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  34.88 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 
517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  37.66 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  36.4 
 
 
513 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  37.64 
 
 
512 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
529 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 
501 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  37.64 
 
 
501 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  36.98 
 
 
512 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  35.95 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
513 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  36.49 
 
 
512 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  37.67 
 
 
506 aa  243  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  36.55 
 
 
514 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 
523 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  36.44 
 
 
517 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  37.91 
 
 
499 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  36.33 
 
 
503 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  37.66 
 
 
499 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  36.09 
 
 
517 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  36.03 
 
 
517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 
502 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  36.59 
 
 
495 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  36.84 
 
 
507 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 
507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.47 
 
 
502 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  26.45 
 
 
510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 
501 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.85 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  27.97 
 
 
501 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.89 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.06 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  26.38 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  25.1 
 
 
524 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.87 
 
 
520 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.67 
 
 
500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.2 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25.2 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.2 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.3 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.2 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.07 
 
 
502 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  29.73 
 
 
489 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.05 
 
 
512 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
512 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  24.43 
 
 
482 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.06 
 
 
524 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  23.66 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.66 
 
 
524 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  23.15 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  25 
 
 
482 aa  117  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  25.88 
 
 
492 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  29.33 
 
 
307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.1 
 
 
513 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 
420 aa  111  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.89 
 
 
502 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.89 
 
 
502 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  25.64 
 
 
326 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  29.17 
 
 
288 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  24.41 
 
 
486 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  24.41 
 
 
486 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  21.69 
 
 
531 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  28.72 
 
 
321 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  24.18 
 
 
486 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  25.73 
 
 
312 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.04 
 
 
301 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  31.6 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
323 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  25.97 
 
 
311 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 
307 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  26.39 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  35.26 
 
 
570 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  26.38 
 
 
498 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  24.42 
 
 
317 aa  94.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  24.68 
 
 
519 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 
545 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 
545 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  30.67 
 
 
303 aa  93.2  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  32.9 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  28.05 
 
 
312 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.22 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  28.21 
 
 
319 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>