35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4716 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  34.86 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  29.5 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  29.5 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  29.12 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  29.12 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  28.2 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3574  hypothetical protein  24.84 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  26.41 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  26.41 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  24.22 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  25.61 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  24.9 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  26.16 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  26.38 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  28.05 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  23.87 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  23.87 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  23.87 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  23.87 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  22.22 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  22.22 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.98 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  22.22 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  24.19 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  21.83 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  23.41 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  23.41 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  23.41 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  23.41 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  25.38 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 954 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  25.32 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  23.26 
 
 		 301 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  22.69 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>