40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4684 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  55.1 
 
 		 793 aa  661    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1474    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  51.58 
 
 		 785 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  49.81 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  51.37 
 
 		 763 aa  635  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  49.56 
 
 		 801 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  50.42 
 
 		 735 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  49.58 
 
 		 755 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  49.86 
 
 		 710 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  42.95 
 
 		 749 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  41.29 
 
 		 749 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  40.22 
 
 		 813 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  38.88 
 
 		 747 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  40.95 
 
 		 763 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  44.17 
 
 		 770 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  44.75 
 
 		 773 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  38.53 
 
 		 854 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  42.42 
 
 		 826 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  26.86 
 
 		 762 aa  266  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  30.54 
 
 		 1295 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  27.01 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  21.42 
 
 		 837 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  30.96 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  23.51 
 
 		 853 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  28.88 
 
 		 830 aa  127  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  25.03 
 
 		 759 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  50.37 
 
 		 831 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  27.72 
 
 		 759 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 		 759 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  27.77 
 
 		 759 aa  118  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  26.93 
 
 		 759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  26.02 
 
 		 759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  26.58 
 
 		 828 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  24.57 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  35.42 
 
 		 836 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  24.29 
 
 		 944 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  23.33 
 
 		 893 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>