39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1841 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  55.05 
 
 
831 aa  738    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  53.4 
 
 
735 aa  678    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  55.57 
 
 
710 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  50.67 
 
 
812 aa  644    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  58.86 
 
 
785 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  100 
 
 
801 aa  1544    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  49.56 
 
 
755 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  51.3 
 
 
755 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  46.88 
 
 
763 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  52.4 
 
 
793 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  45.41 
 
 
749 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  42.18 
 
 
747 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  43.6 
 
 
749 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  48.13 
 
 
763 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  43.24 
 
 
854 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  46.78 
 
 
770 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  47.02 
 
 
773 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  46.59 
 
 
813 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  46.5 
 
 
826 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  26.69 
 
 
762 aa  255  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  20.4 
 
 
837 aa  157  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  29.51 
 
 
1295 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  26.79 
 
 
759 aa  131  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  26.79 
 
 
759 aa  131  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
759 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  26.79 
 
 
759 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  26.62 
 
 
759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  27.12 
 
 
759 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  26.12 
 
 
759 aa  127  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  23.36 
 
 
853 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  27.95 
 
 
830 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  26.73 
 
 
759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  26.32 
 
 
764 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  29.23 
 
 
817 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  28.46 
 
 
828 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  26.62 
 
 
836 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  33.62 
 
 
1330 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  32.14 
 
 
770 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  25.99 
 
 
893 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>