13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3406 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  47.66 
 
 		 944 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 893 aa  1829    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  45.93 
 
 		 940 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2023  hypothetical protein  45.95 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434949  normal  0.479969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  50.77 
 
 		 350 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  23.06 
 
 		 763 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  20.33 
 
 		 762 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  26.69 
 
 		 763 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  23.75 
 
 		 755 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  21.13 
 
 		 837 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1330 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  22.33 
 
 		 749 aa  45.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  27.13 
 
 		 747 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>