39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2881 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  54.62 
 
 		 836 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  100 
 
 		 759 aa  1487    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  55.86 
 
 		 817 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  41.94 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  40.25 
 
 		 764 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  36.64 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  36.42 
 
 		 759 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  36.38 
 
 		 759 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  36.38 
 
 		 759 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  36.38 
 
 		 759 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  36.51 
 
 		 759 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  36.54 
 
 		 759 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  40.75 
 
 		 770 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  26.58 
 
 		 853 aa  181  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  29.81 
 
 		 828 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  28.11 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  26.39 
 
 		 749 aa  149  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  23.78 
 
 		 747 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  29.85 
 
 		 710 aa  144  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  31.46 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  25.65 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  29.41 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  27.14 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  22.5 
 
 		 837 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  23.12 
 
 		 762 aa  127  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  26.54 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  25.26 
 
 		 763 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  27.23 
 
 		 773 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  26.34 
 
 		 770 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  30.52 
 
 		 812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  25.52 
 
 		 813 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  29.21 
 
 		 1295 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  25.24 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  43.43 
 
 		 826 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  27.41 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 793 aa  70.5  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1330 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  33.06 
 
 		 831 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  23.48 
 
 		 524 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>