40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4845 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  51.67 
 
 		 813 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  100 
 
 		 854 aa  1694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  43.04 
 
 		 763 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  48.76 
 
 		 749 aa  588  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  39.06 
 
 		 747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  41.95 
 
 		 831 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  42.02 
 
 		 812 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  42.1 
 
 		 770 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  41.15 
 
 		 755 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  42.04 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  39.82 
 
 		 785 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  43.47 
 
 		 801 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  40.67 
 
 		 763 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  41.42 
 
 		 793 aa  489  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  38.78 
 
 		 755 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  44.32 
 
 		 749 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  43.86 
 
 		 735 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  40.87 
 
 		 826 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  42.32 
 
 		 710 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  29.87 
 
 		 762 aa  258  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  19.49 
 
 		 837 aa  151  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  26.93 
 
 		 830 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  26.02 
 
 		 817 aa  121  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  25.47 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  26.76 
 
 		 836 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  35.9 
 
 		 853 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1330 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  27.93 
 
 		 1295 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  44.44 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  35.14 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  42.42 
 
 		 770 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  37.76 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  25.16 
 
 		 944 aa  61.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  24.68 
 
 		 940 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>