40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1278 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  100 
 
 
812 aa  1524    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  51.75 
 
 
785 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  60.53 
 
 
793 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  49.49 
 
 
755 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  51.06 
 
 
735 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  50.31 
 
 
763 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  48.26 
 
 
831 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  49.93 
 
 
755 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  50.76 
 
 
710 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  50.67 
 
 
801 aa  582  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  43.8 
 
 
763 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  42.02 
 
 
854 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  40.2 
 
 
747 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  40.53 
 
 
749 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  41.26 
 
 
749 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  45.19 
 
 
813 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  42.88 
 
 
770 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  43.47 
 
 
773 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  46.73 
 
 
826 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  28.95 
 
 
762 aa  213  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  20.36 
 
 
837 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  25.9 
 
 
759 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  25.9 
 
 
759 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  27.48 
 
 
759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  27.66 
 
 
759 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  27.16 
 
 
764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  25.94 
 
 
759 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 
759 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  27.37 
 
 
759 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  30.64 
 
 
1295 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  31 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  22.63 
 
 
853 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  30.26 
 
 
817 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  32.94 
 
 
1330 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  30.77 
 
 
770 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  28.55 
 
 
836 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  40.19 
 
 
830 aa  72  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  38.68 
 
 
828 aa  61.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  30.37 
 
 
944 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  28.78 
 
 
350 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>