40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6229 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  40.24 
 
 		 853 aa  611  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  25.67 
 
 		 837 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  28.76 
 
 		 836 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  28.3 
 
 		 764 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  30.45 
 
 		 759 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  24.4 
 
 		 762 aa  172  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  26.4 
 
 		 817 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  27.92 
 
 		 759 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 		 759 aa  156  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  28.13 
 
 		 759 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  27.43 
 
 		 759 aa  155  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  27.99 
 
 		 759 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  27.99 
 
 		 759 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  28.16 
 
 		 759 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  26.63 
 
 		 749 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  30.25 
 
 		 830 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  29.05 
 
 		 770 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  26.89 
 
 		 755 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  27.29 
 
 		 747 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  25.19 
 
 		 749 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  28.48 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  27.18 
 
 		 763 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  28.73 
 
 		 770 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  28.6 
 
 		 773 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  28.65 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  27.3 
 
 		 755 aa  110  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  25.9 
 
 		 813 aa  103  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  25.54 
 
 		 785 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  30.04 
 
 		 735 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  27.77 
 
 		 812 aa  95.5  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  26.58 
 
 		 1295 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  27.38 
 
 		 801 aa  91.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  29.78 
 
 		 793 aa  90.1  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  25 
 
 		 831 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  27 
 
 		 854 aa  84.7  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  25.76 
 
 		 826 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1330 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  25.97 
 
 		 944 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  30.56 
 
 		 940 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>