12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2926 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2023  hypothetical protein  92.85 
 
 		 618 aa  1029    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434949  normal  0.479969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  100 
 
 		 944 aa  1873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  46 
 
 		 893 aa  783    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  74.73 
 
 		 940 aa  1328    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  93.98 
 
 		 350 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  26 
 
 		 763 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  24.03 
 
 		 755 aa  50.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  25.3 
 
 		 830 aa  49.7  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  27.45 
 
 		 755 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  24.69 
 
 		 763 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  28.57 
 
 		 812 aa  48.9  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  28.12 
 
 		 793 aa  45.8  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>