38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0755 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  100 
 
 
747 aa  1544    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  46.29 
 
 
763 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  44.43 
 
 
749 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  43.18 
 
 
749 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  43.19 
 
 
735 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  37.98 
 
 
854 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  41.8 
 
 
801 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  41.21 
 
 
785 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  40.42 
 
 
755 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  43.4 
 
 
710 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  39.44 
 
 
812 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  38.87 
 
 
770 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  39.24 
 
 
773 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  39.25 
 
 
755 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  40.03 
 
 
793 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  42.14 
 
 
813 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  37.81 
 
 
763 aa  479  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  38.43 
 
 
826 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  40.79 
 
 
831 aa  438  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  29.21 
 
 
762 aa  316  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  23.15 
 
 
837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  26.39 
 
 
1295 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  29.58 
 
 
759 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  29.01 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  28.44 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  29.01 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  29.01 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 
759 aa  149  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  29.58 
 
 
759 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  23.29 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  25.79 
 
 
830 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  22.64 
 
 
853 aa  134  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  24.6 
 
 
764 aa  130  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  25.39 
 
 
1330 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  27.49 
 
 
828 aa  119  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  24.75 
 
 
817 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  26.88 
 
 
770 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  23.63 
 
 
836 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>