38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4579 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  100 
 
 		 831 aa  1613    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  61.95 
 
 		 735 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  53.73 
 
 		 801 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  52.39 
 
 		 785 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  49.36 
 
 		 755 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  46.22 
 
 		 755 aa  608  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  47.73 
 
 		 812 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  50.06 
 
 		 793 aa  598  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  42.08 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  44.89 
 
 		 763 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  43.42 
 
 		 763 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  41.51 
 
 		 813 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  41.42 
 
 		 749 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  37.65 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  54.91 
 
 		 710 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  41.89 
 
 		 770 aa  479  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  42.62 
 
 		 773 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  44 
 
 		 826 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  44.94 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  27.32 
 
 		 762 aa  192  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  27.84 
 
 		 836 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  25.79 
 
 		 764 aa  94  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  27.62 
 
 		 817 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  20.77 
 
 		 837 aa  90.5  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1330 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  30.08 
 
 		 1295 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  31.44 
 
 		 770 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  30.87 
 
 		 830 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  26.23 
 
 		 759 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  26.4 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  26.4 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  26.38 
 
 		 759 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  26.06 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  26.4 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  30.13 
 
 		 853 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  35.88 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  32.39 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.130306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>