43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2430 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0755  hypothetical protein  46.29 
 
 
747 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  46.21 
 
 
755 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4023  hypothetical protein  47.02 
 
 
749 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.528793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  100 
 
 
763 aa  1537    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3513  hypothetical protein  46.2 
 
 
749 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4845  hypothetical protein  42.29 
 
 
854 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6472  hypothetical protein  46.37 
 
 
785 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255501  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1511  hypothetical protein  45.71 
 
 
770 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273453  normal  0.683191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1790  hypothetical protein  46.3 
 
 
773 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462246  normal  0.0987848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1841  hypothetical protein  46.88 
 
 
801 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00003479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1460  hypothetical protein  46.78 
 
 
735 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  43.52 
 
 
812 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2172  hypothetical protein  48.14 
 
 
710 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4579  hypothetical protein  43.42 
 
 
831 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.848749  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2046  hypothetical protein  45.26 
 
 
793 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  42.25 
 
 
763 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3740  hypothetical protein  47.02 
 
 
813 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516978  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4684  hypothetical protein  41.89 
 
 
755 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1553  hypothetical protein  41.6 
 
 
826 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323576  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  30.52 
 
 
762 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  21.73 
 
 
837 aa  161  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0133  hypothetical protein  26.03 
 
 
853 aa  145  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7548  hypothetical protein  25 
 
 
764 aa  144  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  28.57 
 
 
830 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02007  hypothetical protein  29.35 
 
 
759 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1528  hypothetical protein  29.29 
 
 
759 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.735894  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02049  hypothetical protein  29.35 
 
 
759 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 
1295 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0924  hypothetical protein  29.21 
 
 
759 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.504013  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2254  hypothetical protein  29.16 
 
 
759 aa  138  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1538  conserved hypothetical protein  29.16 
 
 
759 aa  138  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.163739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2408  hypothetical protein  29.08 
 
 
759 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2881  hypothetical protein  25.42 
 
 
759 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.130306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0600  hypothetical protein  24.47 
 
 
836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6229  hypothetical protein  26.78 
 
 
828 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1396  hypothetical protein  26.75 
 
 
770 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  26.59 
 
 
1330 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1886  hypothetical protein  27.22 
 
 
817 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  25.53 
 
 
940 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  23.51 
 
 
893 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  28.63 
 
 
350 aa  61.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  28.87 
 
 
944 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2023  hypothetical protein  27.86 
 
 
618 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434949  normal  0.479969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>