277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4587 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  78.52 
 
 
140 aa  219  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 
135 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  53.17 
 
 
179 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  52.31 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  43.41 
 
 
140 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  39.73 
 
 
154 aa  128  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  49.6 
 
 
176 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  48.91 
 
 
140 aa  128  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  44.96 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  42.74 
 
 
139 aa  117  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  42.64 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  43.09 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
139 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 
140 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 
137 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  47.69 
 
 
181 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  40.77 
 
 
144 aa  107  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  42.34 
 
 
137 aa  105  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  42.34 
 
 
137 aa  105  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  42.34 
 
 
137 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  46.32 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  37.1 
 
 
139 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
151 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  44 
 
 
136 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 
138 aa  103  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  37.98 
 
 
134 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 
138 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  41.61 
 
 
137 aa  103  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  41.61 
 
 
137 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  41.61 
 
 
137 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  41.61 
 
 
137 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 
138 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  41.61 
 
 
137 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
175 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  40.88 
 
 
137 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  41.41 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  41.09 
 
 
139 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  38.4 
 
 
139 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  40.77 
 
 
137 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  42.64 
 
 
136 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  37.21 
 
 
135 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.2 
 
 
143 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  38.02 
 
 
152 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  40.6 
 
 
198 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  38.57 
 
 
144 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
169 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 
137 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  47.46 
 
 
145 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  37.3 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0095  CoA-binding domain protein  44.03 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  41.98 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  34.85 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  36.51 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  36 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  37.59 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  36.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  36.51 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  36.51 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  37.21 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  44.96 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  35.97 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30080  predicted CoA-binding protein  52.67 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130624  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  34.96 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  42.11 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  41.61 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  41.13 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  42.28 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  39.6 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  36 
 
 
134 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  43.09 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  39.02 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  39.1 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  38.69 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  34.62 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  43.9 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  39.29 
 
 
148 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  39.23 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  39.37 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  43.09 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 
140 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  38.57 
 
 
148 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
152 aa  87  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  39.84 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  39.84 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>