More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2784 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  78.18 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  79.39 
 
 		 285 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  71.38 
 
 		 269 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  71.37 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  63.67 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  61.78 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  63.92 
 
 		 258 aa  338  7e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  64.37 
 
 		 256 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  60.69 
 
 		 314 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  60.69 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  61.6 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  59.54 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  61.54 
 
 		 316 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  63.79 
 
 		 258 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  59.22 
 
 		 304 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  62.35 
 
 		 320 aa  322  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  61.15 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  58.69 
 
 		 307 aa  321  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  60.77 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  60.77 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  60.77 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  61.39 
 
 		 304 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  61.39 
 
 		 304 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  60.62 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  56.81 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  63.52 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  59.07 
 
 		 337 aa  318  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  60.38 
 
 		 316 aa  318  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  58.82 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  58.69 
 
 		 359 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  60.16 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  60.78 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  57.79 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  59.54 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  59.62 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  59.62 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  59.62 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  60.4 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  57.03 
 
 		 308 aa  314  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  59.23 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  57.79 
 
 		 308 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  60.55 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  59.22 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  60.16 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  63.95 
 
 		 513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  56.65 
 
 		 308 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  60.4 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  58.3 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  66.82 
 
 		 300 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  56.44 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  57.03 
 
 		 274 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  56.98 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  56.25 
 
 		 309 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  60.32 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  58.85 
 
 		 304 aa  308  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  58.43 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  60.09 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  54.02 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  60.4 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  57.25 
 
 		 273 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  59.92 
 
 		 297 aa  304  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  57.53 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  60.4 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  62.16 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  59.34 
 
 		 280 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  59.58 
 
 		 393 aa  301  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  60.99 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  55.09 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  57.25 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  59.32 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  56.79 
 
 		 271 aa  298  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  62.67 
 
 		 357 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  57.43 
 
 		 302 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  61.71 
 
 		 365 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  60.54 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  59.57 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  60.09 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  55.77 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  61.75 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  60.34 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  57.94 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  62.67 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  59.32 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  57.14 
 
 		 272 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  61.33 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  56.43 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  59.41 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  56.28 
 
 		 277 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  56.91 
 
 		 271 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  60.78 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  57.92 
 
 		 271 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  59.46 
 
 		 391 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  58.74 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  58.37 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  58.74 
 
 		 340 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  55.37 
 
 		 340 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  61.16 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  58.74 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  56.25 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>