32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2227 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  32.99 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  36.97 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  37.14 
 
 		 181 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  40.35 
 
 		 167 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  36.88 
 
 		 484 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  41.38 
 
 		 85 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  42.31 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  42.19 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1198 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  32.1 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1138  hypothetical protein  54.05 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  34.22 
 
 		 163 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  38.27 
 
 		 94 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  40.59 
 
 		 985 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  37.7 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  36.67 
 
 		 1131 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  42 
 
 		 1110 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  40.68 
 
 		 1089 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  40.68 
 
 		 1093 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  40.68 
 
 		 1093 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  39.81 
 
 		 207 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  32.18 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  37.21 
 
 		 1889 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  29.29 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>