57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1218 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1218  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 343 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4176  Mammalian cell entry related domain protein  34.68 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1241  Mammalian cell entry related domain protein  29.22 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0839  hypothetical protein  27.09 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0942104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3795  Mammalian cell entry related domain protein  24.56 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0006  hypothetical protein  26.25 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2982  Mammalian cell entry related domain protein  26.72 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0963  hypothetical protein  26.04 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  25.66 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0367  virulence factor Mce family protein  25 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2244  virulence factor Mce family protein  23.41 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1171  virulence factor Mce family protein  21.79 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4166  Fis family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.802783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  27.54 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03740  virulence factor Mce family protein  25.48 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2984  virulence factor Mce family protein  26.9 
 
 		 329 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2159  virulence factor Mce family protein  25.75 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0707  virulence factor Mce family protein  25.24 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.953173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0112  virulence factor Mce family protein  25.77 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1170  virulence factor Mce family protein  24.91 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0131  virulence factor Mce family protein  25.77 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307486  normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0122  virulence factor MCE-like protein  25.77 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3019  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2103  virulence factor Mce family protein  25.46 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1656  virulence factor MCE-like protein  27.07 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.593757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1680  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1629  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4168  virulence factor Mce family protein  27.06 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09340  virulence factor Mce family protein  26.42 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0515  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0650  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0504991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2820  virulence factor Mce family protein  23.47 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4600  virulence factor Mce family protein  27.73 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11999  MCE-family protein mce3C  27.74 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10174  MCE family lipoprotein LprK  22.64 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0136  virulence factor Mce family protein  24.82 
 
 		 523 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  27.11 
 
 		 523 aa  47  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4164  virulence factor Mce family protein  24.27 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2570  virulence factor Mce family protein  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2578  virulence factor Mce family protein  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3667  virulence factor MCE-like protein  23.94 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3740  virulence factor Mce family protein  23.94 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2533  virulence factor MCE-like protein  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3680  virulence factor Mce family protein  23.94 
 
 		 436 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3980  virulence factor Mce family protein  25.15 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2161  virulence factor Mce family protein  25.11 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  22.04 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2509  virulence factor Mce family protein  21.52 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31094  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  29 
 
 		 164 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.16 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4184  virulence factor Mce family protein  22.12 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  22.45 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4602  virulence factor Mce family protein  25.95 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4149  virulence factor Mce family protein  22.13 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10172  MCE-family protein mce1C  26.97 
 
 		 515 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1549  virulence factor Mce family protein  24.38 
 
 		 438 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1526  virulence factor MCE-like protein  24.38 
 
 		 438 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>