184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0610 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  49.79 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  47.39 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  50 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  48.65 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  50.43 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  48.95 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  47.73 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  47.21 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  47.21 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  47.21 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  49.27 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  46.5 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  41.43 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  36 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  38.89 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  38.89 
 
 		 812 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  36.11 
 
 		 810 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  35.42 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6756  ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit-like protein  37.35 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  35.17 
 
 		 823 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  35.17 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  35.17 
 
 		 824 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  35.17 
 
 		 825 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  35.17 
 
 		 821 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  33.33 
 
 		 834 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  35.17 
 
 		 843 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  35.17 
 
 		 846 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  37.24 
 
 		 812 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  35.33 
 
 		 822 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  35.33 
 
 		 822 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  34.72 
 
 		 811 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  32.28 
 
 		 851 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  34.03 
 
 		 811 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  34.03 
 
 		 811 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  34.48 
 
 		 842 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  34.48 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  34.48 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  33.79 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  33.79 
 
 		 851 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  33.79 
 
 		 834 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  33.1 
 
 		 852 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  34.72 
 
 		 812 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  33.79 
 
 		 830 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 841 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 852 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 836 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  33.79 
 
 		 835 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  33.79 
 
 		 839 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  33.33 
 
 		 829 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  34.48 
 
 		 859 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 837 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  33.79 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 855 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  33.79 
 
 		 836 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  33.79 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  33.79 
 
 		 834 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  33.11 
 
 		 843 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  33.79 
 
 		 854 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 850 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  33.79 
 
 		 830 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  33.79 
 
 		 830 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  35.42 
 
 		 810 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  33.1 
 
 		 858 aa  72  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  34.72 
 
 		 818 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  34.72 
 
 		 818 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  33.1 
 
 		 846 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  33.1 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  33.1 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  33.1 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  33.1 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  33.1 
 
 		 847 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  34.48 
 
 		 868 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  33.1 
 
 		 848 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  31.94 
 
 		 814 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  35.17 
 
 		 855 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  35.17 
 
 		 825 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  35.17 
 
 		 855 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  35.17 
 
 		 859 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  34.03 
 
 		 817 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  31.51 
 
 		 862 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  34.64 
 
 		 820 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  34.48 
 
 		 843 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  31.94 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  33.33 
 
 		 825 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  32.19 
 
 		 854 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  34.67 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  33.79 
 
 		 842 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  31.72 
 
 		 861 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  33.79 
 
 		 842 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  36.36 
 
 		 860 aa  66.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>