20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0461 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  52.08 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  48.04 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  32.56 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  29.43 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  27.42 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  29.53 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  30.57 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.37 
 
 		 636 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  32.43 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  33.18 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  25.71 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  32.29 
 
 		 714 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  26.29 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  27.83 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  28.39 
 
 		 634 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  28.88 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  27.86 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  27.86 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  25.36 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>