26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3717 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.22 
 
 		 288 aa  487  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  56.21 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  59.09 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  37.41 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  37.41 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  35.69 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  35.47 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  28.09 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  44.62 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  28.77 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.83 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  27.01 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  23.38 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  30.5 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  30.5 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.9 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  27.68 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>