More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1956 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
352 aa  703    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  98.58 
 
 
352 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.43 
 
 
350 aa  531  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.93 
 
 
349 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  78 
 
 
350 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  74 
 
 
350 aa  524  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.47 
 
 
352 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.29 
 
 
350 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
345 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
345 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.04 
 
 
339 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 
338 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.14 
 
 
344 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.59 
 
 
337 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  52 
 
 
343 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1774  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.57 
 
 
337 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  51 
 
 
338 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 
344 aa  328  6e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
341 aa  328  9e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.86 
 
 
341 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
340 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
338 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.38 
 
 
340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
338 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
341 aa  318  6e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
341 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
336 aa  317  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
341 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.7 
 
 
341 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  52 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4170  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.01 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  51 
 
 
339 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4197  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0332622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2768  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.14 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
340 aa  306  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.42 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4054  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
337 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2563  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.58 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0973109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3945  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
338 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
342 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46120  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.74 
 
 
348 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
339 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
338 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
341 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
336 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
346 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
342 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
337 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
342 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
337 aa  291  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.12 
 
 
341 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
349 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
341 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0217  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
339 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
349 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
337 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  44 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.42 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.12 
 
 
341 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1138  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
341 aa  288  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
341 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
341 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
341 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.97 
 
 
349 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1189  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
346 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0318107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
343 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
349 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0145  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
337 aa  286  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00673476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1395  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
341 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00625631  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
340 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 
349 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.73 
 
 
349 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
341 aa  285  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 
339 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3461  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0073  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 
344 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.96 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
349 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1132  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.73 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.92 
 
 
349 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
343 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
355 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
355 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2586  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
341 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
344 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>