82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3127 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
78 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  88.16 
 
 
77 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  73.68 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  72.97 
 
 
77 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  69.74 
 
 
77 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  71.62 
 
 
77 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  62.67 
 
 
77 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  62.67 
 
 
77 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  61.33 
 
 
77 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  59.15 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  63.49 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  50.67 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  54.79 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  46.58 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  49.3 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  48 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  53.12 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  54.72 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  58.06 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  49.35 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0392  preprotein translocase, SecG subunit  41.56 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  38.36 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  54.9 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1727  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1014  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0745  preprotein translocase, SecG subunit  59.46 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  42.67 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  37.04 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0098  preprotein translocase subunit SecG  37.29 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  34.72 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  38.36 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1722  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000381518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0916  preprotein translocase, SecG subunit  41.94 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  41.43 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  32.88 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  35.53 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  32.88 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0441  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0456  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  39.47 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  29.87 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  32.39 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  38.03 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 
123 aa  40  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 
128 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>