50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2253 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 83 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  73.97 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  59.15 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  69.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  46.75 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  59.15 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  63.24 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  48.05 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  54.41 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  54.93 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  48.65 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  49.21 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  52.17 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  46.27 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  45.59 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  46.27 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  48.48 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  48.48 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  50.82 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  47.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  43.55 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  47.83 
 
 		 74 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  46.27 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  43.84 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  45.33 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  43.28 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  36.36 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  36.36 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  38.81 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  38.89 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  38.89 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  36.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>