38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15770 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
73 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  65.08 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  60 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  60.61 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  55.88 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  55.38 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  53.12 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  53.52 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  47.14 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  50.77 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  46.38 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  52.17 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  45.16 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  45.16 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  43.28 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  45.16 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  49.18 
 
 
77 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  42.19 
 
 
77 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  55.56 
 
 
78 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  39.44 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  46.77 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  39.73 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  38.03 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  45.21 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  42.19 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0916  preprotein translocase, SecG subunit  36.92 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>