41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2112 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
78 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  61.84 
 
 
83 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  63.64 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  56.16 
 
 
79 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  54.17 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  53.52 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  57.53 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  60.27 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  59.15 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  50.7 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  52.11 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  52.11 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  45.07 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  50.68 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  47.76 
 
 
77 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  53.62 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  49.32 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  51.35 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  46.58 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  52.24 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  37.97 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  37.97 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  39.73 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  37.97 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  40.26 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1727  preprotein translocase subunit SecG  30.67 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>