37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2867 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
81 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  51.35 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  52 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  45.71 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  48.05 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  46.58 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  44 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  44.12 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  41.1 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  41.1 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  50.7 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  41.1 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  54 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  39.44 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  38.81 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  35.21 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1345  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0694845  normal  0.232595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>