30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0392 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0392  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1727  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1014  preprotein translocase subunit SecG  41.77 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  41.56 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  34.67 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  37.66 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 
77 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0405  preprotein translocase subunit SecG  54.35 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  33.77 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  35.06 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1304  preprotein translocase subunit SecG  48.33 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0673  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000486042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1483  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000405026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  31.51 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0098  preprotein translocase subunit SecG  39.58 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  33.77 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl068  preprotein translocase subunit SecG  42.55 
 
 
88 aa  42  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  33.77 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>