107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2466 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  100 
 
 
367 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  41.39 
 
 
363 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  41.39 
 
 
364 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  32.68 
 
 
361 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  32.14 
 
 
366 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  29.01 
 
 
363 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  25.41 
 
 
368 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  29 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  27.91 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  31.02 
 
 
385 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  26.87 
 
 
364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  28.75 
 
 
361 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  28.61 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  28.49 
 
 
360 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  30.7 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  28.34 
 
 
365 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  26.92 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  28.09 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  28.49 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  23.85 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  27.3 
 
 
369 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  27.06 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  25.07 
 
 
365 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  29.46 
 
 
360 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  27.49 
 
 
362 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  21.43 
 
 
356 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  30.54 
 
 
182 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  27.38 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  24.73 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.59 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  26.25 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  27.27 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  23.93 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  23.93 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  23.93 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  27.54 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  25.38 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  24.61 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  23.84 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  24.92 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  26.43 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  23.72 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  23.02 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  23.47 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  25.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  25.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  25.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  25.64 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  25.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  25.86 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  23.97 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  25.71 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  25.51 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  20.28 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  25.82 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  22.41 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  25.41 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  25.5 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  25.18 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  22.52 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  24.44 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  24.84 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  23.95 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  25.44 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  23.05 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  24 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  21.3 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  22.41 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  20.87 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  22.63 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  27.37 
 
 
306 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  25.8 
 
 
359 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  25.16 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  24.18 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  21.4 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  24.07 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  24.18 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  22.22 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  22.22 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  21.16 
 
 
364 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  23.24 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  21.05 
 
 
366 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  21.35 
 
 
364 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  24.14 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  23.24 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  23.24 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  22.54 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  22.82 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  20.99 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  22.53 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  22.92 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  22.92 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  22.8 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0200  spore germination protein B  21.43 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0235  spore germination protein  20.92 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  20.7 
 
 
374 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  18.93 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  23.23 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  22.22 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  20.87 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>