33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2389 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  35.09 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  40.7 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  37.87 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  38.1 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  36.27 
 
 
243 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0093  hypothetical protein  43.67 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000428603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  25.67 
 
 
2228 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  19.38 
 
 
667 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  29.15 
 
 
204 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  26.51 
 
 
228 aa  63.5  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
1082 aa  63.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0728  hypothetical protein  22.67 
 
 
155 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  37.88 
 
 
252 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0986  CpcD phycobilisome linker-like  26.14 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0488106  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  30.37 
 
 
1411 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  25.95 
 
 
1981 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0038  hypothetical protein  40 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.7 
 
 
1235 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N38  BdrQ  32.05 
 
 
139 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0659504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.87 
 
 
1153 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  28.71 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  19.18 
 
 
1860 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  26.56 
 
 
198 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  26.5 
 
 
213 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  34.76 
 
 
294 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  23.79 
 
 
2115 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  18.53 
 
 
689 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1084  hypothetical protein  26.5 
 
 
196 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00445822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  19.3 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  24.12 
 
 
1914 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1557  hypothetical protein  23.66 
 
 
255 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  18.99 
 
 
497 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>