27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2601 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  100 
 
 		 358 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  83.99 
 
 		 357 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  53.5 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  53.07 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  53.07 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  53.07 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  52.23 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  53.07 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  53.07 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  52.23 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  51.96 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  51.4 
 
 		 349 aa  358  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  50.84 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  28.97 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  27.83 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  26.5 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  22.57 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  28.67 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  29.57 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  30.88 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  27.02 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  33.6 
 
 		 596 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  28.17 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  30.83 
 
 		 545 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  27.68 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  30.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0836  hypothetical protein  26.63 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>