More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0118 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  97.16 
 
 
141 aa  276  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  89.58 
 
 
144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  88.89 
 
 
144 aa  265  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  88.89 
 
 
144 aa  265  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  88.19 
 
 
144 aa  265  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  82.52 
 
 
145 aa  243  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  79.17 
 
 
144 aa  234  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  77.78 
 
 
144 aa  235  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  77.78 
 
 
144 aa  235  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  77.78 
 
 
144 aa  234  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  74.31 
 
 
144 aa  225  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  83.7 
 
 
137 aa  224  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  75 
 
 
144 aa  222  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  75.52 
 
 
144 aa  222  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  76.39 
 
 
145 aa  221  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  77.24 
 
 
145 aa  221  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  82.96 
 
 
137 aa  221  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  73.79 
 
 
145 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  70.83 
 
 
144 aa  219  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  75.52 
 
 
144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  74.48 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  74.1 
 
 
142 aa  216  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  75 
 
 
140 aa  216  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  75.86 
 
 
144 aa  215  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  78.32 
 
 
143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  69.54 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  72.41 
 
 
147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  77.94 
 
 
137 aa  209  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  72.54 
 
 
143 aa  208  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  70.63 
 
 
143 aa  206  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  69.23 
 
 
143 aa  204  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  71.74 
 
 
140 aa  204  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
137 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
139 aa  203  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  69.5 
 
 
142 aa  202  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  73.88 
 
 
138 aa  202  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  71.22 
 
 
139 aa  201  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
140 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  70.92 
 
 
142 aa  199  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  70.92 
 
 
142 aa  199  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  73.33 
 
 
137 aa  199  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  70.37 
 
 
138 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  66.2 
 
 
142 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  68.89 
 
 
137 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  69.29 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 
141 aa  197  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
139 aa  197  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  69.63 
 
 
139 aa  197  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  70.37 
 
 
141 aa  197  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 
137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  65.25 
 
 
139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  65.93 
 
 
138 aa  194  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  71.32 
 
 
137 aa  194  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 
139 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 
137 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 
140 aa  193  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 
140 aa  193  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  68.79 
 
 
142 aa  193  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 
139 aa  193  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
140 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  65 
 
 
139 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 
138 aa  192  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
140 aa  192  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 
139 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  69.12 
 
 
144 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  61.11 
 
 
160 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  67.15 
 
 
144 aa  192  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 
158 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  66.42 
 
 
139 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
139 aa  190  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  65.73 
 
 
144 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  65.73 
 
 
144 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  66.18 
 
 
138 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  57.82 
 
 
160 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  65.69 
 
 
145 aa  189  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
140 aa  189  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  58.5 
 
 
160 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 
141 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  65.69 
 
 
137 aa  189  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 
179 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  65.93 
 
 
139 aa  189  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 
138 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 
141 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  64.44 
 
 
137 aa  188  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>