21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2643 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  100 
 
 		 143 aa  298  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  80.62 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  49.14 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  36.15 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  41.28 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  47.13 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  40.91 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  40.91 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  40.91 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  34.35 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  30.71 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  29.33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  28.47 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  31.54 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  34.41 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  35.16 
 
 		 458 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  32 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.74 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>