More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1808 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  71.27 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  65.94 
 
 		 400 aa  358  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  62.99 
 
 		 413 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  66.55 
 
 		 284 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  61.17 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  61.17 
 
 		 278 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  52.99 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  52.06 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  52.47 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  56.83 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  51.48 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  52.25 
 
 		 394 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 347 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 399 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  52.59 
 
 		 396 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.54 
 
 		 285 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.97 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  53.06 
 
 		 397 aa  248  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  44.88 
 
 		 412 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  45.22 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  50.81 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 282 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.86 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.86 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  51.33 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  45.26 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  57.32 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 		 269 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  48.01 
 
 		 407 aa  235  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  51.15 
 
 		 345 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  53.76 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  47.21 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 266 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  51.15 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  43.96 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.99 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50.41 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  44.69 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  47.24 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  52.26 
 
 		 257 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  52.65 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.89 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  46.09 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  52.65 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.44 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  45.19 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  41.84 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.44 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  52 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  42.71 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  42.6 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  52.23 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>