254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1411 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  100 
 
 		 331 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  74.77 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  70.22 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  65.75 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  64.69 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  61.93 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  59.19 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  58.39 
 
 		 324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  54.69 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  56.88 
 
 		 334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  34.84 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  33.76 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  33.79 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.54 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  30.77 
 
 		 357 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  27.18 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  27.18 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  25.32 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  26.89 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  27.12 
 
 		 362 aa  89  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.36 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  27.27 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.95 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  26.6 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  28 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  27.27 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  28 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  28 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  24.72 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.33 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  23.38 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  25.66 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  24.81 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  25.28 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.98 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  27.64 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  27.64 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.64 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  23.32 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  26.86 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  24.31 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1054  arsenical-resistance protein  24.17 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0721949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  26.13 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  24.18 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  26.44 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  24.91 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  25.89 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  26.09 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  24.56 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  25.55 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  25.52 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.65 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  24.81 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  24.36 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  24.44 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03336  arsenical pump membrane protein, putative  28.68 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  23.86 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  23.44 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  25.67 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  25.97 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  24.27 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  25.63 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  25.98 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  24.36 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4522  arsenical-resistance protein  24.27 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4609  arsenical-resistance protein  24.27 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  25.64 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4905  arsenical-resistance protein  24.27 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  25.32 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.44 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  24.6 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  24.28 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  25.63 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  25.63 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00490  Arsenical-resistance protein  25.09 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.137298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  25.63 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  24.27 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  26.23 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  25.32 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.38 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  23.72 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  25.76 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  23.97 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  25 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>