32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1269 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1269  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2314    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1126 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1120 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1122 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 1041 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  31.74 
 
 		 492 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1074 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1109 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 814 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1075 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  37.76 
 
 		 609 aa  52.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.34 
 
 		 2182 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1188 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 		 893 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 931 aa  49.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 935 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1054 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  36.96 
 
 		 1514 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  34.04 
 
 		 966 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  33.78 
 
 		 992 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1010 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.25 
 
 		 1453 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  21.97 
 
 		 919 aa  46.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1105 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.55 
 
 		 2171 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 1065 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  41.46 
 
 		 693 aa  45.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1077 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 1105 aa  45.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.21 
 
 		 855 aa  45.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 		 1578 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1069 aa  44.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>