22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3082 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  88.97 
 
 		 417 aa  756    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  71.14 
 
 		 428 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  41.94 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  23.12 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.94 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  23.48 
 
 		 464 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  20.38 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  24.23 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20.46 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.82 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  20.92 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  23.72 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  23.47 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  21.92 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  21.15 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  18.48 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  21.58 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  27.1 
 
 		 511 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  23.6 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  19.23 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  21.75 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>