32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2645 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  61.18 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  50.59 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  60 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  40.24 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  48.19 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  42.68 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  47.44 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  42.17 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.68 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  30.12 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  48.21 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  40.7 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  49.09 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  34.94 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  32.93 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.47 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  38.46 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.37 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.71 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  32.94 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  43.08 
 
 		 90 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>