More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2625 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  76.17 
 
 
663 aa  1011    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  96.53 
 
 
663 aa  1292    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  63.03 
 
 
654 aa  829    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  75.57 
 
 
663 aa  1012    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
663 aa  1330    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  71.89 
 
 
657 aa  924    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  75.57 
 
 
662 aa  1018    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  54.49 
 
 
664 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  72.62 
 
 
665 aa  956    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  43.67 
 
 
688 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  43.26 
 
 
689 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  43.83 
 
 
688 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.92 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.97 
 
 
649 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  50.11 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  52.05 
 
 
488 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  51.84 
 
 
488 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  40.34 
 
 
616 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  39.22 
 
 
607 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  41.84 
 
 
654 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  39.81 
 
 
661 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  39.84 
 
 
663 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  44.42 
 
 
480 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  38.52 
 
 
659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.06 
 
 
614 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  38.75 
 
 
650 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  36.38 
 
 
607 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  35.06 
 
 
634 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  32.31 
 
 
572 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.47 
 
 
571 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.23 
 
 
658 aa  294  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  32.25 
 
 
623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  33.9 
 
 
616 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.73 
 
 
619 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.42 
 
 
606 aa  272  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  30.59 
 
 
576 aa  270  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30.55 
 
 
662 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  31.05 
 
 
576 aa  269  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  29.69 
 
 
680 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  30.59 
 
 
576 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  32.66 
 
 
624 aa  267  4e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  30.33 
 
 
657 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  32.36 
 
 
637 aa  264  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.18 
 
 
646 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 
669 aa  256  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.1 
 
 
776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.44 
 
 
665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
647 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.84 
 
 
669 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  29.47 
 
 
620 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  30.68 
 
 
647 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
741 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  30.92 
 
 
741 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.02 
 
 
783 aa  250  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 
676 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.89 
 
 
647 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
786 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
770 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.35 
 
 
676 aa  244  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  32.84 
 
 
774 aa  244  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 
662 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  28.51 
 
 
712 aa  244  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 
774 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 
662 aa  243  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  31.97 
 
 
770 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 
662 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  31.91 
 
 
720 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  31.02 
 
 
738 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  29.27 
 
 
743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  30.3 
 
 
740 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  240  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 
713 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  28.38 
 
 
666 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
662 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  30.69 
 
 
716 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  31.58 
 
 
747 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  30.02 
 
 
764 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  31.45 
 
 
844 aa  237  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  29.92 
 
 
740 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.24 
 
 
680 aa  236  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  30.74 
 
 
778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  29.53 
 
 
772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29.8 
 
 
666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.35 
 
 
786 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  29.44 
 
 
764 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 
715 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 
764 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 
714 aa  233  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  28.93 
 
 
764 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 
764 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  30.92 
 
 
691 aa  231  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  29.83 
 
 
728 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  30.35 
 
 
749 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 
631 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>