44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1941 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  100 
 
 		 256 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  90.23 
 
 		 256 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2303  sporulation domain-containing protein  38.97 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00342773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  37.89 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1435  sporulation-related protein  37.02 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.419741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1018  sporulation domain-containing protein  35.89 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0660774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1136  Sporulation domain protein  31.67 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  35.42 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  42.19 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  26.15 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  28.1 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  30.33 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  24.55 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  29.68 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  33.33 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  37.5 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  25.73 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  32.52 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.43 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  36.21 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  35.8 
 
 		 176 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  27.03 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  38.46 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  38.71 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  38.71 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  38.71 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  29.68 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  31.4 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  34.21 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  34.48 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  38.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  25.21 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  31.03 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  27.42 
 
 		 186 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  31.43 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  35.19 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  25.4 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  27.1 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  37.21 
 
 		 215 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 		 277 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>