21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1455 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1455  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 430 aa  875    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 856 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  26.77 
 
 		 858 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  32.16 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  27.98 
 
 		 849 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  31.51 
 
 		 828 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  25.62 
 
 		 852 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 868 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  28.71 
 
 		 713 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  31.11 
 
 		 703 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1103 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  28.49 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  29.32 
 
 		 869 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 711 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  27.42 
 
 		 729 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.52 
 
 		 1056 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.52 
 
 		 1053 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.76 
 
 		 1054 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  23.76 
 
 		 1054 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>