More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6399 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  100 
 
 		 560 aa  1115    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  41.63 
 
 		 321 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  48.39 
 
 		 289 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  47.89 
 
 		 689 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  46.33 
 
 		 479 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  46.24 
 
 		 401 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  45.09 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  44.38 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  36.76 
 
 		 722 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  40.12 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  41.42 
 
 		 413 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  41.07 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  37.95 
 
 		 385 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  33.51 
 
 		 192 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  37.35 
 
 		 411 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  31.63 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  39.02 
 
 		 338 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  31.63 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  31.63 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  36.47 
 
 		 611 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  35.48 
 
 		 191 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  35.94 
 
 		 191 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  31.55 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  33.77 
 
 		 248 aa  88.6  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  32.94 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  34.04 
 
 		 222 aa  87.8  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  36.17 
 
 		 191 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  38.41 
 
 		 192 aa  87  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  27.56 
 
 		 428 aa  87  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  32.98 
 
 		 192 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  32.98 
 
 		 192 aa  87  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  32.98 
 
 		 192 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  33.54 
 
 		 191 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  32.91 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  32.45 
 
 		 191 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  34.68 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  36.42 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  30.32 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  30.32 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  36.91 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  32.98 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  34 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  34.57 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  34.59 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  33.51 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  32.11 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.57 
 
 		 590 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  36.71 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  37.75 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  33.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  28.85 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  33.86 
 
 		 205 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  30.95 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  57.14 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  33.73 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  33.51 
 
 		 191 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  33.96 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  31.18 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  34.44 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  27.81 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  27.81 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  49.32 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  30.23 
 
 		 232 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  31.49 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  34.16 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  32.09 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  32.91 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  32.68 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  31.38 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  26.52 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  33.85 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  32.68 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  36 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  34.23 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  53.12 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  33.11 
 
 		 192 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  28.72 
 
 		 192 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  32.89 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  28.19 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  27.81 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  31.79 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  31.79 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  30.5 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  28.19 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  33.33 
 
 		 194 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  32.67 
 
 		 191 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  30.92 
 
 		 194 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  47.76 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  31.13 
 
 		 191 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3023  stress protein  30.43 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102186  hitchhiker  0.000574983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  43.21 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  26.15 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>