More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6230 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6230  sulphate transporter  100 
 
 
590 aa  1100    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  56.77 
 
 
536 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19500  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  53.62 
 
 
576 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132441  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0425  sulphate transporter  58.06 
 
 
582 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0873  SulP family sulfate permease  56.76 
 
 
597 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  45.42 
 
 
549 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  44.62 
 
 
557 aa  345  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  43.01 
 
 
585 aa  333  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  44.11 
 
 
548 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  43.37 
 
 
546 aa  326  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  43.96 
 
 
549 aa  320  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  43.96 
 
 
549 aa  320  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2343  sulphate transporter  46.88 
 
 
551 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.968955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1119  sulphate transporter  44.6 
 
 
546 aa  316  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  44.14 
 
 
549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  38.63 
 
 
570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2042  sulphate transporter  47.64 
 
 
564 aa  303  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  33.45 
 
 
570 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  32.8 
 
 
568 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  34.12 
 
 
556 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  32.28 
 
 
568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  36.45 
 
 
567 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  36.26 
 
 
567 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  33.21 
 
 
587 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2086  sulphate transporter  44.7 
 
 
554 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0836406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  36.68 
 
 
568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  37.38 
 
 
559 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  38.37 
 
 
551 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  31.27 
 
 
552 aa  272  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  33.45 
 
 
568 aa  272  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  33.7 
 
 
550 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  31.45 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  33.09 
 
 
553 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  37.15 
 
 
604 aa  269  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  38.12 
 
 
581 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  36.87 
 
 
559 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  35.14 
 
 
553 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  34.36 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  32.31 
 
 
552 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  34.07 
 
 
606 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  32.25 
 
 
545 aa  265  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  35.14 
 
 
553 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  33.46 
 
 
560 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  37.79 
 
 
572 aa  258  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  32.24 
 
 
583 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  36.78 
 
 
573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  38.52 
 
 
552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  30.02 
 
 
551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  36.72 
 
 
555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  35.15 
 
 
572 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  30.02 
 
 
551 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  39.38 
 
 
553 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  39.16 
 
 
550 aa  253  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  33.02 
 
 
587 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  33.94 
 
 
563 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  36.86 
 
 
581 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  34.62 
 
 
587 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  34.44 
 
 
587 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  34.44 
 
 
587 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  34.44 
 
 
587 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  35.39 
 
 
594 aa  247  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  33.33 
 
 
588 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  35.22 
 
 
575 aa  246  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  35.02 
 
 
563 aa  246  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  35.08 
 
 
590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  38.62 
 
 
594 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.12 
 
 
579 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  32.86 
 
 
585 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  34.69 
 
 
590 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  34.5 
 
 
590 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  34.55 
 
 
577 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  34.91 
 
 
583 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  38.17 
 
 
580 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  28.77 
 
 
605 aa  232  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  33.2 
 
 
573 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  33.02 
 
 
579 aa  232  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  29.75 
 
 
552 aa  230  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  34.43 
 
 
545 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  35.19 
 
 
583 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  37.53 
 
 
564 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  31.94 
 
 
575 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  35.61 
 
 
544 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  32.34 
 
 
574 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  35.7 
 
 
586 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  34.99 
 
 
565 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  34.87 
 
 
632 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  33.21 
 
 
560 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  33.81 
 
 
554 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  26.93 
 
 
563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  34.22 
 
 
578 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  34.29 
 
 
558 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  34.97 
 
 
587 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  35.12 
 
 
571 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  33.98 
 
 
565 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  33.98 
 
 
565 aa  217  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  33.98 
 
 
565 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  34.54 
 
 
581 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  32.84 
 
 
573 aa  217  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  34.39 
 
 
567 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  36.81 
 
 
426 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>