More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0425 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0425  sulphate transporter  100 
 
 
582 aa  1096    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19500  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  66.43 
 
 
576 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132441  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0873  SulP family sulfate permease  67.95 
 
 
597 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  65.68 
 
 
536 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6230  sulphate transporter  57.02 
 
 
590 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2343  sulphate transporter  53.41 
 
 
551 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.968955  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  48.28 
 
 
549 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  46.68 
 
 
585 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  46.45 
 
 
557 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  47.9 
 
 
548 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  47.16 
 
 
546 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  47.47 
 
 
549 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  47.47 
 
 
549 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  47.65 
 
 
549 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2042  sulphate transporter  53.56 
 
 
564 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1119  sulphate transporter  48.17 
 
 
546 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2086  sulphate transporter  50.82 
 
 
554 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0836406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  38.55 
 
 
570 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  39.78 
 
 
604 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  37.6 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  33.64 
 
 
570 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  33.46 
 
 
568 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  35.61 
 
 
606 aa  296  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  33.58 
 
 
556 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  34.78 
 
 
587 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  34.85 
 
 
553 aa  294  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  37.12 
 
 
568 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  34.09 
 
 
552 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  36.04 
 
 
558 aa  289  9e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  33.21 
 
 
568 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  32.41 
 
 
552 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  32.71 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  40.19 
 
 
551 aa  286  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  37.41 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  32.33 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  40.49 
 
 
555 aa  283  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  36.8 
 
 
553 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  33.21 
 
 
545 aa  281  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  33.94 
 
 
583 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  33.46 
 
 
550 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  40.48 
 
 
552 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  35.28 
 
 
567 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  33.14 
 
 
552 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  38.12 
 
 
581 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  35.09 
 
 
567 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  32.12 
 
 
568 aa  276  9e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  39.61 
 
 
572 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  34.11 
 
 
587 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  32.71 
 
 
560 aa  272  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  34.5 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  37.55 
 
 
594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  37.62 
 
 
581 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  36.02 
 
 
563 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  41.95 
 
 
553 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  33.46 
 
 
552 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.89 
 
 
579 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  36.26 
 
 
559 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  38.6 
 
 
575 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  36.09 
 
 
587 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  37.15 
 
 
583 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  36.09 
 
 
590 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  35.9 
 
 
587 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  35.9 
 
 
587 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  35.71 
 
 
588 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  37.16 
 
 
550 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  35.39 
 
 
585 aa  256  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  38.15 
 
 
577 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  35.9 
 
 
590 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  39.96 
 
 
573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  35.9 
 
 
590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  35.9 
 
 
587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  30.51 
 
 
605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  34.57 
 
 
553 aa  253  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  29.13 
 
 
563 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  36.81 
 
 
587 aa  249  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  38.11 
 
 
544 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  37.33 
 
 
545 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  35.96 
 
 
564 aa  243  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  36.22 
 
 
558 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  32.29 
 
 
560 aa  240  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  38.92 
 
 
632 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  35.91 
 
 
586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  32.53 
 
 
574 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  33.75 
 
 
575 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4169  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  57.42 
 
 
459 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  31.62 
 
 
573 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  39.08 
 
 
580 aa  230  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  33.75 
 
 
565 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  33.75 
 
 
565 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  35.91 
 
 
583 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  35.98 
 
 
578 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  33.75 
 
 
565 aa  228  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  34.12 
 
 
573 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  33.73 
 
 
541 aa  226  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  36.85 
 
 
581 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  35.21 
 
 
565 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  30.4 
 
 
561 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1067  putative sulfate transporter YchM  37.03 
 
 
572 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1057  sulphate transporter  30.22 
 
 
574 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0213258  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  35.14 
 
 
594 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>